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肺纤维化是一种致命的慢性肺部疾病，其特征是肺部组织逐渐被瘢痕组织取代，导致呼吸功能不可逆地丧失。尽管现有药物可以减缓疾病进展，但没办法阻止或逆转这一过程。长期以来，(肌)成纤维细胞被认为是肺纤维化中过度产生细胞外基质(ECM)的主要细胞类型。然而，近年研究之后发现，远端肺上皮损伤和肺泡II型上皮细胞(AT2)的异常重编程可能在病理过程中扮演更关键的角色。在这一研究背景下，来自瑞典隆德大学(Lund University)和德国亥姆霍兹慕尼黑研究中心(Helmholtz Zentrum München)的研究团队发现，纤维化的AT2细胞通过转录共激活因子YAP调控ECM的产生和交联。YAP通过增加赖氨
在真核细胞中，约四分之一的基因编码膜蛋白，这些蛋白质负责物质运输和信息传递等关键生命活动。然而，膜蛋白的结构形成过程极易出错——特别是含有非理想跨膜结构域(TMD)的蛋白质，如长度不匹配或暴露极性残基的TMD，这些特征虽然对功能至关重要，却会破坏其在膜中的稳定性。内质网膜蛋白复合体(EMC)此前已被确认为跨膜结构域插入酶(insertase)，但其复杂的十亚基结构暗示着更多未知功能。慢慢的变多的证据说明，EMC可能还扮演着分子伴侣的角色，协助膜蛋白正确折叠和组装，但这一功能的分子机制一直未被阐明。德国慕尼黑工业大学(Technische Universität München)的Matthias
在人类文明发展史上，马匹的驯化彻底改变了战争、交通和农业生产的模式。然而，现代家马（DOM2谱系）的单一性掩盖了曾经遍布欧亚大陆的野生马群多样性。伊比利亚半岛（今西班牙和葡萄牙地区）作为古代优质马匹的著名产地，其马群演化历史长期存在两大谜团：一是当地特有的IBE野生谱系何时灭绝？二是驰名古典时代的伊比利亚马究竟有何种遗传优势？法国图卢兹大学人类生物学与基因组学研究中心（Centre dAnthropobiologie et de Genomique de Toulouse）的Jaime Lira Garrido团队联合国际研究小组，通过对87例距今26,800年至现代的马匹样本做全基因组测
立克次体病是由蜱虫传播的致命性感染，其中落基山斑点热（RMSF）死亡率高达20-50%。尽管这类疾病威胁日益严重，但近80年来始终缺乏FDA批准的有效疫苗。传统灭活疫苗仅提供部分保护，而亚单位疫苗的研发又受限于对抗体保护机制的认识不足。更棘手的是，立克次体作为专性胞内病原体，其免疫保护需要同时调动体液免疫和细胞免疫，这使得疫苗设计面临双重挑战。美国德克萨斯大学医学分部（University of Texas Medical Branch）的研究团队在《npj Vaccines》发表的研究取得突破性进展。该团队利用前期开发的减毒立克次体株R. parkeri 3A2（通过破坏噬菌体整合酶基因获得
染色体作为遗传物质的核心载体，其结构演变规律一直是进化基因组学研究的焦点。通过重建祖先核型(Ancestral Cell Karyotypes, ACKs)和染色体进化轨迹(Chromosome Evolutionary Trajectories, CETs)，科学家们得以揭示植物基因组在亿万年演化过程中经历的结构重塑奥秘。研究团队创新性地开发了全基因组加倍(Whole-Genome Duplication, WGD)整合分析工具包，该工具采用独特的端粒中心模型(telomere-centric model)，通过系统比较不同植物基因组内及基因组间的基因共线性(gene collinearit
在热带地区肆虐的蚊媒病毒中，寨卡病毒(ZIKV)与登革病毒(DENV)的分子模仿秀给疫苗研发带来了独特挑战。2015年美洲寨卡疫情暴发期间，科学家们发现一个令人担忧的现象：这两种黄病毒家族成员表面E蛋白的高度相似性，导致免疫系统产生的抗体常常敌我不分。更棘手的是，这种交叉反应可能引发抗体依赖性增强(ADE)效应——就像给病毒配备了特洛伊木马，让它们更容易侵入免疫细胞。这种现象在登革热疫苗Dengvaxia接种者中已有先例，凸显了开发特异性寨卡疫苗的紧迫性。Integral Molecular, Inc.的研究团队在《Cell Reports》发表的研究中，采用分子手术刀策略精确解剖
人类胸腺T细胞发育过程中DNA甲基化重塑的双波动态及其在增殖中的稳定性研究
在免疫系统的精密调控中，T细胞的胸腺发育一直被视为生命科学的黑箱。尽管已知胸腺细胞要经历严格的选择和分化过程，但人类胸腺T细胞发育的表观遗传调控机制仍如雾里看花。传统观点认为，DNA甲基化(DNAmeth)会随着细胞增殖逐渐丢失，特别是在异染色质区域，此现状在成熟T细胞中已被广泛证实。然而，胸腺细胞在经历多次增殖爆发后，其表观遗传景观如何维持稳定？这个谜题必然的联系到我们对免疫系统发育的理解，也影响着T细胞相关疾病的治疗策略。柏林健康研究所再生治疗中心的研究团队在《Cell Reports》发表的研究，通过绘制人类胸腺T细胞发育全过程的DNA甲基化图谱，揭开了这一过程的神秘面纱。研究人员
(p)ppGpp梯度调控铜绿假单胞菌运动性与抗生素耐受性的分子机制及其在生物膜形成中的作用
在微生物与宿主的博弈中，铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)以其惊人的环境适应能力著称，尤其擅长通过形成生物膜抵抗宿主免疫和抗生素攻击。这种机会性病原体在囊性纤维化(CF)患者肺部建立的慢性感染，往往导致终身难以根治的炎症反应。问题的核心在于细菌如何感知环境压力并启动精准的生存策略？其中，被称为细菌应激中枢的(p)ppGpp信号分子（鸟苷四/五磷酸）被认为是调控这一过程的关键开关，但其作用模式究竟是简单的开/关切换还是存在更精细的调控层次，一直是领域内未解的谜题。来自德国汉诺威医学院(Medizinische Hochschule Hannover)和丹麦奥胡斯
VP35（病毒蛋白35）作为埃博拉病毒（EBOV）的第二基因编码产物，VP35是一种35 kDa的多功能蛋白，其结构与副黏病毒、弹状病毒的磷蛋白同源。该蛋白包含N端寡聚化结构域和C端免疫抑制结构域（IID），两者通过柔性连接区串联。IID特有的中心碱性斑块和第一碱性斑块是其结合dsRNA、抑制RIG-I样受体（RLR）信号通路的核心区域。VP35结构晶体结构显示，VP35 IID采用α-螺旋/β-折叠双亚域构象。其中K309位点的TRIM6介导的泛素化修饰可增强病毒聚合酶活性，而R225与K63连接的非锚定泛素链结合可能调控复制功能。磷酸化质谱分析发现S187位点修饰可能会影响IID的R
肺转移作为膀胱癌等原发性肿瘤的常见致命并发症，其发生与自然杀伤(NK)细胞功能失调紧密关联。这项创新性研究揭示：静脉注射卡介苗(BCG)在小鼠模型中展现出惊人的预防效果——通过强力激活NK细胞，使肺部转移灶显著减少并大幅延长生存期。然而当肿瘤已然形成时，狡猾的癌细胞会启动干扰素-γ(IFN-γ)信号通路进行武装抵抗，过度表达PD-L1等免疫检查点分子构筑防护盾。有趣的是，当研究人员敲除肿瘤细胞的IFN-γ信号通路时，BCG的治疗效果竟能部分恢复！这些发现不仅解密了肿瘤免疫逃逸的新机制，更指引着将百年老药BCG改造为阻击癌症转移的免疫哨兵。
这项研究开展了一场机器学习(ML)模型的巅峰对决，聚焦于预测荧光团(fluorophores)那个调皮的光物理参数——斯托克斯位移(Stokes shift)。科研团队搬出了当下最火的自动化机器学习神器H2OAutoML，让它与传统的梯度提升回归器同台竞技。结果令人眼前一亮：H2OAutoML以R2=0.83的优异成绩碾压了历史梯度提升回归器的0.71，活脱脱一个学霸碾压学渣的戏码。深入分析发现，那个名字长得像绕口令的BCUT2D_LOGPLOW描述符（Burden-CAS-University of Texas 2D with low logP eigenvalues）与斯托克斯
能量代谢与性成熟互作机制：鸡下丘脑多组学整合分析揭示营养-生殖调控新通路
家禽性成熟进程与机体营养状态紧密关联，下丘脑作为能量代谢与生殖调控的神经内分泌枢纽，如何整合外周营养信号仍属科学谜题。研究团队设计不同能量水平的饲料干预实验，在母鸡初产日龄采集下丘脑组织，运用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术开展蛋白质组-代谢组联合解析。数据揭示：饲养期膳食能量通过重塑糖代谢关键酶己糖激酶1(HK1)、三羧酸循环组分二氢硫辛酰胺乙酰转移酶(DLAT)和苹果酸脱氢酶1(MDH1)的活性，明显影响下丘脑能量代谢流。代谢组分析显示谷氨酸、缬氨酸、亮氨酸等氨基酸代谢物呈现能量依赖性差异表达。信号通路分析发现，不同能量组间谷氨酸受体1(GluR1)、胆囊收缩素(CCK)、阿黑皮
在畜禽养殖业中，骨骼健康必然的联系到动物福利与生产效益，而维生素D代谢与骨重塑过程的个体差异长期困扰着育种实践。猪作为与人类生理高度相似的大型模型，其血清中维生素D储存形式钙化二醇(25(OH)D3)和活性形式钙化三醇(1,25(OH)2D3)的浓度波动，以及骨吸收标志物β-CTX和骨形成标志物CICP的水平变化，背后可能隐藏着关键的遗传密码。德国农场动物生物学研究所(FBN, Research Institute for Farm Animal Biology)的研究团队通过大规模群体分析，首次系统解析了这些性状的遗传架构。研究人员采用全基因组关联研究(GWAS)技术，对610头纯种德国长白猪
AI驱动的H&E与IHC双模态图像分析预测结直肠癌和乳腺癌生物标志物及生存结局
在肿瘤精准治疗时代，免疫检查点抑制剂如pembrolizumab（抗PD-1抗体）已显著改善微卫星不稳定性高（MSI-H）/错配修复缺陷（MMRd）结直肠癌和PD-L1阳性三阴性乳腺癌（TNBC）患者的生存结局。然而，传统生物标志物检测的新方法——包括免疫组化（IHC）和二代测序（NGS）——存在耗时费力、主观性强等瓶颈。尤其对于PD-L1评估，其复杂的联合阳性评分（CPS）系统更增加了临床判读的变异性。如何突破现存技术局限，实现高效、标准化的生物标志物检测，成为肿瘤病理学的迫切需求。Caris Life Sciences（美国凤凰城）的研究团队在《Communications Medicine》
酿酒酵母代谢工程改造实现新黄质高效合成：突破微生物合成瓶颈与抗氧化活性开发
在天然产物领域，类胡萝卜素因其独特的生物活性和商业经济价值非常关注。作为含氧类胡萝卜素的重要成员，新黄质(neoxanthin)展现出比β-胡萝卜素和叶黄素更强的抗氧化活性，能显著抑制前列腺癌细胞增殖，还是化妆品成分β-紫罗兰酮(β-damascenone)和岩藻黄质(fucoxanthin)的关键前体。然而传统植物提取法面临含量低(仅占类胡萝卜素总量的9-14%)、季节性波动大(含量变化达20-30%)等瓶颈，且有机溶剂提取工艺存在环境隐患。这些限制严重制约了新黄质的规模化应用，亟需开发可持续的微生物合成方案。智利天主教大学的研究团队选择酿酒酵母作为合成底盘，通过系统代谢工程策略实现了新黄质的异
类风湿关节炎(RA)作为一种以关节破坏为特征的自身免疫性疾病，现有生物制剂存在需频繁注射和免疫原性等问题。尤其有必要注意一下的是，成纤维样滑膜细胞(FLS)在RA病理过程中扮演关键角色，其侵袭性增殖依赖于钙激活钾通道(KCa1.1)的活性。虽然蝎毒来源的伊比利亚毒素(IbTX)能选择性抑制KCa1.1αβ3亚型（FLS主要表达型）而避免神经毒性，但肽类药物的口服吸收难题长期制约其临床应用。贝勒医学院的研究团队创新性地将合成生物学与药物递送技术相结合，构建了能分泌IbTX的工程化罗伊氏乳杆菌LrIbTX。通过pheromone诱导表达系统，使益生菌在肠道原位生产具有完整活性的IbTX。研究采用三种关键
综述：糖尿病作为多系统疾病：理解人类糖尿病亚型、并发症及其与脂肪肝疾病的关联
糖尿病作为多系统疾病的全景解读引言糖尿病(DM)已从单纯的糖代谢紊乱概念演变为涉及多器官交互的复杂疾病网络。全球成人患病率达10.5%的现状，促使研究者突破传统T1D/T2D二分法，转向基于表型特征的精准分型体系。Ahlqvist等人提出的聚类模型通过年龄、BMI、HbA1c、HOMA2-IR等临床可及参数，将糖尿病划分为5个具有非常明显预后差异的亚型，为并发症防控提供了全新视角。糖尿病亚型与并发症风险35 kg/m23.0)和低HbA1c。这类患者肝脏脂肪含量比其它亚型高2.3倍，是代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)的高危人群。有必要注意一下的是，PNPLA3 rs738409(G)等位基因携带者
这项横断面研究揭示了内脏脂肪与肌肉比例失衡对肾脏健康的影响。科研团队利用美国国家健康与营养调查(NHANES)2011-2014年数据，采用双能X线吸收法(DXA)精准测量了5765名成年人的内脏脂肪面积(VFA)和四肢骨骼肌质量(ASM)。当尿白蛋白肌酐比(UACR)≥30 mg/g时即判定为蛋白尿阳性。数据分析显示，蛋白尿组的VSR值明显高于正常组(P0.001)。经过多因素校正后，VSR每升高一个单位，蛋白尿风险增加8%(OR=1.08，95%CI:1.03-1.14)。更有必要注意一下的是，与VSR最低三分位数组相比，最高三分位数组的蛋白尿风险激增49%(OR=1.49，95%CI:
在非编码RNA研究领域，环形RNA(circRNA)因其独特的闭合环状结构和调控功能成为热点。然而，超过80%的circRNA功能仍属未知，传统的基于关联的负罪推定(guilt by association)方法面临两大挑战：一是数据库中存在大量假阳性互作（如TargetScan预测的circRNA-miRNA互作假阳性率高达60%），二是静态网络无法反映组织特异性表达模式。这样一些问题严重制约了circRNA作为疾病标志物和治疗靶点的应用价值。捷克理工大学电气工程学院计算机科学系的研究团队在《BioData Mining》发表的研究中，开发了circGPAcorr算法。该工具创新性地将表达数
